scikit-learnをインストールする（win/marvericks）

scikit-learnとは

• 公式
  • http://scikit-learn.org/stable/
• github
  • https://github.com/scikit-learn/scikit-learn
• pythonの機械学習ライブラリ
• 機械学習・統計はRしか触っていなかったので、pythonも触らなくてはと思い使ってみることにした。
• そのための、まずは、インストール

インストールしていくが・・・

サポート環境

公式ドキュメントにも書いてあるが、下記のようなライブラリが必要

• Python本体
  • Python 2.6+ and Python 3.3+
• 依存ライブラリとか
  • NumPy >= 1.6.1
  • SciPy >= 0.9
  • C/C++ compiler
    • このC/C++ compilerが悲劇を起こすことになる

Windows

• インストールバイナリを片っ端からインストールして終わり
  • msiがあるので、簡単
  • C++ compilerをインストールするのを忘れがち

Mac OS X (marvericks)

• Python本体はpyenvでいれた
• NumPy・SciPyはpipでインストールしていけばよい
  • pip install numpy
  • pip install scipy
• C/C++ compilerはxcode commandline toolをインストールすることでインストールされる
  • marvericksからxcode > open developer tool > more developer tool > commandline tool
• scikit-learnをpipでインストールして終わり・・・のはずだった
  • pip install scikit-learn

gccのエラーと戦う

• このstackover flowや、このサイトで紹介されているように、marvericksのgccは何かおかしいらしい？

• pip install scikit-learnってやると下記のようなエラーになった

    clang: error: unknown argument: '-mno-fused-madd' [-Wunused-command-line-argument-hard-error-in-future]
  
    clang: note: this will be a hard error (cannot be downgraded to a warning) in the future
  
    error: Command "c++ -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -arch x86_64 -arch i386 -g -Os -pipe -fno-common -fno-strict-aliasing -fwrapv -mno-fused-madd -DENABLE_DTRACE -DMACOSX -DNDEBUG -Wall -Wshorten-64-to-32 -DNDEBUG -g -fwrapv -Os -Wall -Wstrict-prototypes -DENABLE_DTRACE -arch x86_64 -arch i386 -pipe -I/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/core/include -c sklearn/svm/src/libsvm/libsvm_template.cpp -o build/temp.macosx-10.9-intel-2.7/sklearn/svm/src/libsvm/libsvm_template.o" failed with exit status 1
  
    ----------------------------------------
    Cleaning up...
    Command /usr/bin/python -c "import setuptools, tokenize;__file__='/private/tmp/pip_build_root/scikit-learn/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-INtc9q-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile failed with error code 1 in /private/tmp/pip_build_root/scikit-learn
    Storing debug log for failure in /Users/xxxxx/Library/Logs/pip.log
  

• stackover flowにあったように、エラーを無視するオプションをつけて実行すると動くようになった

  • sudo ARCHFLAGS=-Wno-error=unused-command-line-argument-hard-error-in-future pip install scikit-learn

• 上のコマンドを実行するとコンソールにはこんな感じで表示された（一部抜粋）

  • ものすごいエラーっぽい

      sklearn/linear_model/sgd_fast.c:13885:49: warning: unused function '__Pyx_c_sum' [-Wunused-function]
              static CYTHON_INLINE __pyx_t_double_complex __Pyx_c_sum(__pyx_t_double_complex a, __pyx_t_double_complex b) {
                                                          ^
          sklearn/linear_model/sgd_fast.c:13891:49: warning: unused function '__Pyx_c_diff' [-Wunused-function]
              static CYTHON_INLINE __pyx_t_double_complex __Pyx_c_diff(__pyx_t_double_complex a, __pyx_t_double_complex b) {
                                                          ^
    

• けど、コンソール出力がエラーっぽいけど、インストールは成功する！！

  • 上のワーニングがでている時に、途中で処理を中止していたので、成功するということに２時間ぐらい気がつけなかった

  • くっそ！！

    Partial import of sklearn during the build process. Successfully installed scikit-learn Cleaning up...

• ワーニングでてるのに、ちゃんと成功しているのかめっちゃ不安なので、動かしてみる

  • importしてみたけど、エラーはでなかった

    • 機械学習は動かしてないけど、importできたってことは動くよね。。。？

            Python 3.3.3 (default, Mar 19 2014, 01:44:51)
        [GCC 4.2.1 Compatible Apple LLVM 5.1 (clang-503.0.38)] on darwin
        Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
        >>> from sklearn import datasets
        >>> iris = datasets.load_iris()
        >>> digits = datasets.load_digits()
        >>> digits.target
        array([0, 1, 2, ..., 8, 9, 8])
      

Apple の　LLVMはダメな子らしい！